平均的な収支データとして、第19回医療経済実態調査(医療機関等調査・平成25年実施)が参考になるでしょう。

外科診療所・個人(前年度)
　　医業・介護収益　　105,835千円
　　給与費　　　　　　　　　22.7%
　　損益差額　　　　　　32,733千円(減価償却控除前)
　　施設数　　　　　　　　　　　50施設

外科診療所・法人(前年度)
　　医業・介護収益　　130,998千円
　　給与費　　　　　　　　　51.7%(役員報酬を含む)
　　損益差額　　　　　　　9,854千円(減価償却控除前)
　　施設数　　　　　　　　　　　40施設

平均値であり中央値ではありませんので、ご留意ください。